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用Sciospec EIT-16電阻抗譜成像系統(tǒng)測(cè)量與可視化數(shù)據(jù)處理

發(fā)布時(shí)間:2021-11-26 15:34:18 瀏覽量:3938 作者:Givin

摘要

Sciospec EIT16 - 16通道EIT設(shè)備-是一個(gè)全功能的高帶寬電阻抗斷層成像系統(tǒng)悴势,用于雄心勃勃的研究應(yīng)用。利用Sciospec EIT系統(tǒng)(如EIT16)生成的EIT數(shù)據(jù)以及相應(yīng)的Sciospec軟件可以在基于Matlab的自由軟件EIDORS中導(dǎo)入措伐、處理和可視化特纤。Sciospec提供了適當(dāng)?shù)腗atlab代碼示例和指導(dǎo),以幫助您開(kāi)始使用這個(gè)集合侥加。本應(yīng)用說(shuō)明演示了如何導(dǎo)入和執(zhí)行EIDORS圖像重建使用Matlab代碼提供的Sciospec捧存。使用Sciospec EIT16和相應(yīng)的Sciospec軟件在標(biāo)準(zhǔn)的phantom實(shí)驗(yàn)中生成了一些樣本數(shù)據(jù)。

正文


用Sciospec EIT-16電阻抗譜成像系統(tǒng)測(cè)量與可視化數(shù)據(jù)處理

 

從研究目標(biāo)儀器如EIT16到完全定制的OEM產(chǎn)品,用于生物分析决摧、醫(yī)療和工業(yè)應(yīng)用亿蒸,ScISPec為電阻抗斷層掃描成像提供高度專業(yè)化的解決方案。靈活的通道配置掌桩,頻率掃描模式边锁,可擴(kuò)展性高達(dá)數(shù)百個(gè)通道和廣泛的擴(kuò)展選項(xiàng),通過(guò)傳感器適配器波岛,附加模塊和更多茅坛,使Sciospec EIT系統(tǒng)適合多種雄心勃勃的應(yīng)用。EIDORS (Electrical Impedance Tomography and Diffuse optical tomography Reconstruction Software)是一款用于EIT圖像重建和處理的免費(fèi)軟件则拷。EIDORS基于MATLAB贡蓖,但也與免費(fèi)開(kāi)源的OCTave協(xié)同工作,得到了學(xué)術(shù)界EIT專家的廣泛使用和支持煌茬。Sciospec EIT16 - 16通道EIT設(shè)備-是一個(gè)全功能的高帶寬電阻抗斷層成像系統(tǒng)斥铺,用于雄心勃勃的研究應(yīng)用。利用Sciospec EIT系統(tǒng)(如EIT16)生成的EIT數(shù)據(jù)以及相應(yīng)的Sciospec軟件可以在基于Matlab的自由軟件EIDORS中導(dǎo)入坛善、處理和可視化晾蜘。Sciospec提供了適當(dāng)?shù)腗atlab代碼示例和指導(dǎo)邻眷,以幫助您開(kāi)始使用這個(gè)集合。本應(yīng)用說(shuō)明演示了如何導(dǎo)入和執(zhí)行EIDORS圖像重建使用Matlab代碼提供的Sciospec剔交。使用Sciospec EIT16和相應(yīng)的Sciospec軟件在標(biāo)準(zhǔn)的phantom實(shí)驗(yàn)中生成了一些樣本數(shù)據(jù)肆饶。


生成測(cè)量數(shù)據(jù)

實(shí)施EIT測(cè)量的必要設(shè)備:

Sciospec EIT系統(tǒng)岖常,例如16通道EIT系統(tǒng)(EIT16)驯镊。這包括:

EIT16設(shè)備

Sciospec軟件

16根測(cè)量電纜(16根標(biāo)準(zhǔn)Sciospec MCX-to-banana-plug電纜和16個(gè)鱷魚夾)

電源

USB電纜

Sciospec標(biāo)準(zhǔn)透明水箱

PC

目標(biāo)物,例如中空玻璃筒(絕緣物體)


Sciospec標(biāo)準(zhǔn)的EIT透明水箱直徑為20厘米腥椒,高度為15厘米阿宅,在水箱周圍的一個(gè)水平面上設(shè)置了16個(gè)不銹鋼電極候衍。在模型中裝滿了2.5升的自來(lái)水笼蛛。注:可通過(guò)使用去離子水和添加所需數(shù)量的NaCl或其他鹽得到精確的鹽含量的水。每個(gè)電極逆時(shí)針連接到Sciospec EIT16設(shè)備蛉鹿,使用標(biāo)準(zhǔn)Sciospec MCX-to-banana-plug電纜組滨砍,如圖1所示。


 

 

在Sciospec軟件中設(shè)置測(cè)量參數(shù)妖异,如圖3所示:

頻率:1 point at 100kHz

幅值:10mA

電流源:DC

幀率:30


 

首先,在沒(méi)有任何物體的情況下對(duì)裝滿自來(lái)水的模型進(jìn)行測(cè)量他膳,以獲得“參考”數(shù)據(jù)响逢。通過(guò)添加一個(gè)絕緣性物體(在本例中:直徑3厘米的中空玻璃圓柱體)并將其移動(dòng)到水箱內(nèi)部,產(chǎn)生了“異匙厮铮”數(shù)據(jù)舔亭。通過(guò)選擇數(shù)據(jù)集并按下save按鈕,可以輕松導(dǎo)出數(shù)據(jù)集蟀俊,如圖4所示钦铺。文件存儲(chǔ)在選定的目錄中,包括一個(gè)數(shù)字肢预,文件擴(kuò)展名為'.eit'矛洞。


   

在EIDORS中導(dǎo)入、處理和可視化數(shù)據(jù)

EIDORS (Electrical Impedance Tomography and Diffuse Optical Tomography Reconstruction Software)是一款基于Matlab的EIT數(shù)據(jù)處理可視化軟件烫映。這一部分展示了如何使用Matlab代碼導(dǎo)入'沼本。使用Sciospec軟件生成的文件,并處理和可視化一些樣本數(shù)據(jù)集锭沟。Sciospec根據(jù)請(qǐng)求提供了重做應(yīng)用程序說(shuō)明中所示的過(guò)程所需的所有文件抽兆。

所提供的文件夾中包含三個(gè)Matlab文件:

“fnc_read_Sciospec.m”

“func_ConvertSciospecToEIT.m”,

“Main_SciospecData_with_eidors.m”。


使用提供的Matlab代碼和樣本數(shù)據(jù)集導(dǎo)入冈钦、處理和可視化EIT數(shù)據(jù)的指南:

1.開(kāi)始Matlab

2.打開(kāi)Main_SciospecData_with_eidors.m'

3.啟動(dòng)EIDORS時(shí)郊丛,在代碼的第2行中輸入EIDORS的適當(dāng)文件路徑

4.在第7行和第19行中配置“Reference”和“Anomaly”數(shù)據(jù)的測(cè)量路徑5.

運(yùn)行Matlab腳本(菜單欄中的“run”按鈕) 

注意:如果在這個(gè)應(yīng)用程序中使用的數(shù)據(jù)集與示例數(shù)據(jù)集不同李请,注意:在步驟4中配置整個(gè)代碼(如圖7所示的代碼片段)到您的數(shù)據(jù)集。


 

 


運(yùn)行Matlab腳本后厉熟,將顯示從第1幀到第180幀的時(shí)差EIT成像导盅。差分成像的第36幀如圖8所示。成像顯示了彩色編碼的電導(dǎo)率隨時(shí)間的變化揍瑟。與參考鹽水相比白翻,白色區(qū)域的電導(dǎo)率沒(méi)有變化。藍(lán)色表示其電導(dǎo)率相對(duì)于參考點(diǎn)下降的區(qū)域滤馍。在這個(gè)例子中,使用了一個(gè)中空玻璃物體底循,因此顯示為藍(lán)色巢株。與參考數(shù)據(jù)相比,電導(dǎo)率增加的區(qū)域以紅色顯示熙涤。


 


結(jié)論

在本應(yīng)用說(shuō)明中阁苞,介紹了使用Sciospec EIT系統(tǒng)(如EIT16)生成測(cè)量數(shù)據(jù),在EIDORS中導(dǎo)入祠挫、處理和可視化數(shù)據(jù)的整個(gè)過(guò)程那槽。Sciospec提供的Matlab代碼也可以用于導(dǎo)入其他 '.eit數(shù)據(jù)集。


參考

?//eidors3d.sourceforge.net/index.shtml

?Uses and abuses of EIDORS: An extensible software base for EIT (Andy Adler and William R B Lionheart, Physiol. Meas., 27:S25-S42, 2006)

?Sciospec EIT system manual

?//www.sciospec.de/references/#appnote

?Sciospec EIT16


關(guān)于生產(chǎn)商:

Sciospec專注于電阻抗譜等舔、阻抗斷層成像和其他電化學(xué)/分析技術(shù)的解決方案骚灸。主要應(yīng)用于生物分析,生物傳感器慌植,材料科學(xué)和過(guò)程控

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解決方案涤浇,可擴(kuò)展性是我們DNA中的一部分鳖藕。以O(shè)EM模塊形式存在的Scispec技術(shù)是無(wú)數(shù)生物分析和醫(yī)療應(yīng)用產(chǎn)品的核心。與此同

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新的水平蜻展。

 

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